A ciborgue Major Motoko Kusanagi e seus colegas da Seção 9 enfrentam diversos criminosos, tanto no mundo real quanto no virtual. Ao longo de suas missões, Kusanagi e sua equipe lidam com situações que vão desde crises com reféns até a perseguição de máquinas de matar de última geração que saíram do controle.

O advogado iniciante Naruhodo Ryuichi levanta-se para salvar seus clientes provando suas inocências nos casos mais incomuns! O réu é culpado ou inocente? Acreditando na inocência de seu cliente, Naruhodo vai à corte e batalha seus juízes rivais. Com a palavra "objeção!" e evidências limitadas, Naruhodo dá à volta por cima quando todas as chances estão contra ele e parece que não há mais nada a fazer. Não perca as cenas cômicas entre ele e seu mentor Ayasaho Chihiro, sua assistente Asayato Mayoi e seu promotor rival Mitsuguri Reiji e várias personagens únicas! O anime também mostrará a relação de infância entre Naruhodo e seus amigos. Com as habilidades que herdou de seu mentor, Naruhodo revela a verdade!

O reino de Dowa, que é subdividido em 13 estados, está celebrando o 99º aniversário de seu monarca. Estes 13 estados têm muitas agências que são controlados pela gigante organização conhecida como ACCA. A história acompanha Jean Otis, que é conhecido como o membro mais astuto da ACCA, e o segundo em comando da agência de inspeção. Sua agência tem dez pessoas, em cada um dos 13 estados, com um escritório central na capital.

Primavera de 1999. Admirando e querendo ser uma linda empregada, uma jovem chega a Akihabara. O "Akiba" do final do século está repleto de uma grande variedade de empregadas domésticas. O maid café "Ton Tokoton", comumente conhecido como "Butagoya" (Pig Hut), está aberto hoje também! Eu estava em pânico porque a nova empregada que se juntou à loja comigo era bastante imprevisível. Criadas, treinadoras e outras formas de vida de Akihabara também aparecem, e o morcego vermelho entra em ação! Este é um diário de luta de trabalho de uma empregada de pleno direito, dado a todos os mestres e senhoras. "Estamos esperando você voltar para casa, boo."

Akuma-kun, um garoto criado por um demônio, e seu parceiro Mefistófeles Terceiro, metade humano, resolvem mistérios e assassinatos ligados a fenômenos paranormais.

Há muito tempo, estourou uma guerra no Japão que colocou Kantou contra Kansai e dividiu o país. Kansai tornou-se dependente de Kantou, mas lentamente a polícia e o governo começaram a perder o controle de Kansai para criminosos conhecidos como Akudama.

O detetive Conan viaja até Cingapura para investigar um horrível assassinato ligado a uma lendária pedra conhecida como o "Punho da Safira Azul" e para impedir Kaito Kid de colocar suas mãos na cobiçada joia.